Seit 1986 arbeitet Wolfgang Jansen als Dozent für Theaterwissenschaft (und zeitweise für Kulturmanagement) an verschiedenen Universitäten und Hochschulen, darunter u.a. am Institut für Theaterwissenschaft der Freien Universität Berlin, an der Hochschule für Musik und Theater Hamburg, am Institut für Kulturpolitik der Universität Hildesheim, am Institut für Germanistik der Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf, im Fachbereich Musical an der Folkwang Universität der Künste Essen und von 2008 bis 2021 im Fachbereich Musical an der Universität der Künste Berlin.

Theaterwissenschaftliche Vorträge und Gast-Vorlesungen führten ihn darüber hinaus zu zahlreichen weiteren Institutionen im In- und Ausland, darunter etwa die Universitäten von Istanbul, Wien, Salzburg, München und Freiburg.

Seine thematischen Schwerpunkte sind die Geschichte des populären Musiktheaters im 19. und 20. Jahrhundert sowie die Theatergeschichte im Land Brandenburg.